Panel met. PCR infekcje kości i stawów - 39 oznaczeń (bakterie, drożdżaki, mechanizmy antybiotykooporności)

Panel obejmuje oznaczenia patogenów odpowiedzialnych za infekcję kości i stawów (29 gatunków bakterii i 2 gatunki grzybów drożdżopodobnych) oraz  8 genów warunkujących oporność patogenów na antybiotyki.
Do zakażenia stawów (ZS) dochodzi, gdy patogeny uzyskują dostęp do kości i stawów na drodze krwiopochodnej,  ciągłego rozprzestrzeniania się z sąsiadującej infekcji lub po bezpośredniej implantacji, przykładowo: w przypadkach  otwartego złamania, zabiegów operacyjnych, wszczepiania implantów. ZS obejmują wiele rodzajów zakażeń, w tym septyczne zapalenie stawów (SZS) i zakażenia okołoprotezowe stawów (ZOS). Zakażenia takie są diagnozowane przez połączenie:  wyników badań laboratoryjnych, danych mikrobiologicznych, oceny histologicznej tkanek, kontroli śródoperacyjnej, a w niektórych przypadkach, wyników badań radiograficznych. ZS są najczęściej wywoływane przez patogeny bakteryjne, chociaż istotną przyczyną bywają również drożdżaki. BioFire JI Panel analizuje pojedynczą próbkę płynu stawowego, w kierunku bakterii tlenowych i beztlenowych oraz drożdżaków, które powodują SZS i ZOS, a także markerów genetycznych związanych z opornością na antybiotyki. Szybka identyfikacja drobnoustrojów obecnych w płynie stawowym, wraz, gdy to możliwe, z informacją o obecności genu oporności na antybiotyki dla wybranych drobnoustrojów, są pomocne  w ustaleniu optymalnego leczenia i prowadzenia pacjenta.  Panel zawiera oznaczenia do wykrywania determinantów genetycznych powiązanych z opornością S. aureus na metycylinę (mecA/c, opornością Enterokoków na wankomycynę (vanA i vanB) oraz niektóre mechanizmy oporności bakterii Gram-ujemnych na ß-laktamy, w tym penicyliny, cefalosporyny, monobaktamy i karbapenemy. Wykryty gen lub marker oporności na antybiotyki może, ale nie musi, pochodzić od czynnika etiologicznego zakażenia.
Wyniki ujemne dla wybranych genów oporności na antybiotyki nie oznaczają wrażliwości na antybiotyki, ze względu na istnienie  różnych mechanizmów oporności na metycylinę, wankomycynę i β-laktamy. Wyniki ujemne mogą być powodowane zakażeniem patogenami, które nie są wykrywane przez ten test;  patogenami obecnymi w liczbie mniejszej niż granica wykrywalności oznaczenia lub infekcją, która nie jest wykrywalna w próbce płynu stawowego. Dodatnie wyniki, natomiast, nie wykluczają koinfekcji innymi mikroorganizmami. BioFire JI Panel nie nadaje się  do monitorowania leczenia zakażeń stawów.
Panel uwzględnia:
Bakterie Gram-dodatnie
Anaerococcus prevotii/vaginalis; Clostridium perfringens; Cutibacterium avidum/granulosum; Enterococcus faecalis; Enterococcus faecium; Finegoldia magna; Parvimonas micra; Peptoniphilus; Peptostreptococcus anaerobius; Staphylococcus aureus; Staphylococcus lugdunensis; Streptococcus spp.; Streptococcus agalactiae; Streptococcus pneumoniae Streptococcus pyogenes.
Bakterie Gram-ujemne:
Bacteroides fragilis; Citrobacter; Kompleks Enterobacter cloacae; Escherichia coli; Haemophilus influenzae; Kingella kingae; Klebsiella aerogenes; Grupa Klebsiella pneumoniae; Morganella morganii; Neisseria gonorrhoeae; Proteus spp.; Pseudomonas aeruginosa; Salmonella spp.; Serratia marcescens.
Grzyby drożdżopodobne:
Candida spp, Candida albicans Geny oporności na antybiotyki:
Karbapenemazy – IMP, KPC, NDM, OXA-48-like, VIM; ESBL- CTX-M; Oporność na metycylinę - mecA/C, mecA/C and MREJ (MRSA); Oporność na kolistynę - vanA/B.