Wymaz z odbytu (bad. bakter.)

Wymaz z odbytu wykonywany jest w podejrzeniu zakażenia bakteryjnego przewodu pokarmowego. Wymaz bakteriologiczny wykonywany jest w przypadku objawów sugerujących  zakażenie przewodu pokarmowego: czerwonki bakteryjnej (shigellozy, dyzenterii), zatrucia jadem kiełbasianym, paciorkowcami typu B i innych. W przewodzie pokarmowym obecna jest mikroflora fizjologiczna (stali rezydenci i flora przejściowa), np. E.coli. Flora fizjologiczna daje efekt odporności kolonizacyjnej, chroniąc przed zakażeniem innymi bakteriami, lecz jej gatunki mają  charakter bakterii oportunistycznych i potencjalnie chorobotwórczych.  Do rozwoju nieprawidłowej flory bakteryjnej może dojść po terapii antybiotykami. Ponieważ obraz kliniczny zakażeń przewodu pokarmowego nie zawsze jest typowy dla gatunku, pełna diagnostyka zakażenia wymaga mikrobiologicznej  identyfikacji bakterii, połączonej z ustaleniem ich wrażliwości na leki. Wymaz powinien być wykonany w ostrej fazie zakażenia, przed zastosowaniem antybiotyków lub 5 dni po zakończeniu antybiotykoterapii  ogólnoustrojowej lub leków przeciwbakteryjnych.