Treść jelitowa posiew (bad. bakter.)

Diagnostyka mikrobiologiczna flory bakteryjnej jelita jest przydatna w ocenie równowagi bakteryjnej jelit. W badaniu bakteriologicznym treści jelit określana jest liczba wyhodowanych gatunków bakterii, z uwzględnieniem gatunków tlenowych i beztlenowych; ilość bakterii w 1 ml treści jelitowej: prawidłowych i patologicznych. Zbyt uboga  flora  prawidłowa (gatunki wskaźnikowe) sugeruje możliwość kolonizacji gatunkami patologicznymi. W prawidłowych stanie jelito cienkie zawiera stosunkowo niewielką liczbę bakterii. Stan, w którym w tej części jelita pojawia się zbyt duża liczba bakterii  nazywany jest zespołem rozrostu bakteryjnego, ZRB lub zespołem przerostu flory bakteryjnej w obrębie jelita cienkiego, SIBO, (ang. Small Intestinal Bacterial Overgrowth). ZRB polega na pojawieniu się obcych szczepów bakterii lub nadmiernego wzrostu liczebności naturalnie występujących w jelicie cienkim (> 105 CFU bakterii na ml treści pokarmowej). Przyczynami nadmiernego rozrostu bakterii w jelicie cienkim mogą być: zaburzenia wydzielania soku żołądkowego lub trzustkowego,  zmiany anatomiczne w przewodzie pokarmowym w następstwie choroby (wady zastawki krętniczo-kątniczej lub interwencji chirurgicznej (np.  przetoki żołądkowo-jelitowe i jelitowo-jelitowe), osłabienie  perystaltyki jelit, deficyty IgA, zespół jelita drażliwego. W ZRB jelita mogą ulec kolonizacji przez Bacteroides, Lacidobacillus, Clostridium, Streptococcus, E. coli, Staphylococcus, Klebsiella pneumoniae, Enterococcus spp i Proteus mirabilis).